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堆肥樣品檢測——復(fù)達客戶檢測案例
705 
705 2021年6月28日，客服中心反饋國內(nèi)某科學(xué)研究院有堆肥樣品檢測的需求，接到反饋后，材料檢測實驗室工程師第一時間與客戶進行詳細溝通，情況如下：
客戶背景
客戶是國內(nèi)某科學(xué)研究院的學(xué)生，做了一個關(guān)于堆肥樣品的研究課題，需要檢測堆肥樣品的一些元素，便于課題開展。
樣品名稱
堆肥樣品
測試項目
氮、磷、鉀、總碳、腐殖酸。
客戶需求
需要檢測土壤里面氮、磷、鉀、總碳、腐殖酸，得出數(shù)據(jù)用于課題研究。
解決方案
分析流程：
首先對高通量測序下機的雙端序列原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)量篩查，獲取可用于下游宏基因組學(xué)分析的高質(zhì)量數(shù)據(jù)集（Clean data） 。 隨后對每個樣本的高質(zhì)量序列分別進行宏基因組序列拼接組裝，構(gòu)建宏基因組 Contigs 和 Scaffolds 序列集，并進行基因預(yù)測，獲得非冗余蛋白序列集。隨后，對蛋白序列用多種常用數(shù)據(jù)庫進行功能注釋，獲得各等級的功能類群豐度譜，并進行差異比較分析、代謝通路富集分析、聚類分析等。同時，我們也對基因序列進行物種注釋，獲得種以及種以下精細水平的物種組成譜，并進行差異比較分析、聚類分析、物種組成豐富度和均勻度分析和關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析等。基于上述獲得的功能豐度譜和物種組成譜，可以進一步對宏基因組樣本進行 Alpha 和Beta 多樣性分析，進而依靠多種多變量統(tǒng)計學(xué)方法篩選得到宏基因組中的關(guān)鍵生物標記物（如關(guān)鍵功能/物種類群） 。 同時，通過多種多種數(shù)據(jù)可視化和交互式工具，繪制具備論文發(fā)表水準的二維/三維圖表，全方位、客觀地呈現(xiàn)以上分析結(jié)果。此外，我們還將根據(jù)樣本來源，選擇特定的功能數(shù)據(jù)庫進行注釋分析。
檢測結(jié)果：
客戶反饋
通過我們的檢測，客戶的課題研究有了原始數(shù)據(jù)的支撐，并且對我們的數(shù)據(jù)非常滿意，后面又陸續(xù)送了幾十批樣品。
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